Modelagem molecular

Utiliza modelagem computacional, inteligência artificial e simulações para projetar e selecionar moléculas e materiais com maior potencial de aplicação. Essa etapa permite prever propriedades, otimizar estruturas e direcionar os experimentos de forma mais rápida, segura e eficiente.

Disponibilidade de infraestrutura

UFLA: A infraestrutura já existente no departamento de Química da Universidade Federal de Lavras permite a realização deste projeto. Atualmente, encontram-se disponíveis 2 clusters de computadores (cluster A: 120 processadores 3.9 GHZ intel7, memória RAM 8X64 GB; cluster B: 60 processadores Intel Xeon E5-2620, memória RAM 3X64GB), 1 estação de trabalho Fuel da SGI, 2 estações Octane com o sistema operacional IRIX e 50 microcomputadores com sistema operacional Windows/Linux. Estes recursos computacionais são dedicados aos programas GAMESS-UK6.2, QUANTUM ESPRESSO V.5.1, VASP, ORCA, GROMACS 5.1, AMBER10.0, Gaussian 09, ADF2010, BAND, REAXXF, DALTON2.1, SPARTAN 08, QSAR-4D, ICM-Pro Molegro Virtual Docker 2009 e AUTODOCK4.0. Além disso, a UFLA foi aprovada no projeto: Derivação, otimização e implementação de parâmetros para boro, estanho e platina nos campos de força MMFF94S e AMBER, com potencial para o desenho de novas drogas (mmffdbsnpt) e com isso temos acesso ao supercomputador Santos Dumont (SDumont). O SDumont, adquirido junto a empresa francesa ATOS/BULL, está localizado na sede do Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), em Petrópolis-RJ, atuando como nó central (Tier-0) do Sistema Nacional de Processamento de Alto Desempenho – SINAPAD. O SDumont possui um total de 36.472 núcleos de CPU, distribuídos em 1.134 nós computacionais, os quais são compostos, na sua maioria, exclusivamente por CPUs com arquitetura multi-core. Por fim, o SDumont dispõe de um sistema de arquivos integrado à rede Infiniband, com capacidade bruta de armazenamento da ordem de 1,7 PBytes, bem como um sistema de arquivos secundário com capacidade bruta de 640 TBytes. Outra infraestrutura importante de citar é o Centro de Inovações em Materiais Sustentáveis – CIMS. O CIMS (500 m²) apresenta como equipamentos: extrusoras em escala industrial, misturador termocinético, máquina de ensaio mecânico, estufas, prensas, moinhos e trituradores, misturadores e batedeiras, tribômetro, DRX, FRX, analisador elementar, AFM, câmara climática, câmara de envelhecimento/biodegradação, análise térmica e acústica, agitadores mecânicos e magnéticos, muflas, balanças, spray dryer industrial, entre outros equipamentos.

IME: O LMDQB conta atualmente com toda a infraestrutura necessária para desenvolver estudos de drug design e interações proteína-ligante por modelagem molecular. O laboratório conta com diversas workstations dotadas de placas GPU para computação de alto desempenho, além de todos os softwares necessários, dentre os quais podemos citar PyMOL, VMD, Games, Gaussian®, AutoDock Vina, GROMACs e MOE®.

UFPA: Laboratório de Física-Pesquisa (1.100m2); Laboratório de Física Experimental e Computacional (700m2) dispõe de 3 laboratórios para execução de projetos experimentais: Laboratório de Ótica (32 m2), Laboratório de Espectroscopia (32 m2) e Laboratório de Síntese e Preparação de Materiais composto de três salas: a) Sala de Manipulação de Regentes Químicos e preparação de amostras, com cerca de 20m2, b) Sala de Crescimento de Cristais com cerca de 10m2, c) Sala de Fornos com cerca de 15m2. Além disso, o PPGF-UFPA dispõe de 04 laboratórios: Laboratório de Espectroscopia Vibracional e Altas Pressões (50m2), Laboratório de Raios X, Análise Térmica e Dielétrica (50m2) e Laboratório de Nanomanipulação (50m2).

UFES: 2 computadores Desktop (Processador Intel i9, 64 GB de RAM, HD NVMe ou SSD SATA de 2 TB, PV NVidia GeForce RTX 4090 Ti 24 GB, Water cooler; 2 kits teclado+mouse; 2 monitores de 24"; 2 NoBreak SMS, 3000VA senoidal, bivolt.

Apoio técnico/administrativo para o desenvolvimento do projeto

Para a criação do INCT-Defesa, contamos com dois apoios administrativos por meio da solicitação de duas bolsas AT-NS (Apoio técnico). O primeiro apoio administrativo trata-se da profissional Carla Agostini, que é bacharel em Ciências Contábeis e mestre em Administração, além de possuir uma especialização em MBA de Gestão de Pessoas pela UFSJ. Já o segundo apoio administrativo que o INCT contará, trata-se da profissional Débora Cristina Guerra que é graduada em Administração e mestre em Educação Científica e Ambiental, além de especialista em Gestão de Empresas, Controladoria e Finanças Empresariais e MBA em Gestão de Negócios no Contexto Empreendedor. Além disso, o INCT-Defesa contará com técnicos de laboratório em cada instituição colaboradora deste projeto. Em linhas gerais, podemos considerar que os pesquisadores executores dos objetivos desta proposta terão um excelente apoio administrativo/técnico e infraestrutura especializada e de qualidade.

Financiadores

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• CNPq (Nº do processo: 408584/2024-6)
• FAPEMIG (Nº do processo: APQ-08690-25)
• CAPES (Nº do processo: 88887.205770/2025-00)